Lớp Học Điệp Viên - Spy Kyoushitsu / Spy Classroom, sau các cuộc xung đột quân sự, các quốc gia đã âm thầm bắt đầu cuộc chiến ngầm. Điệp viên Klaus được mệnh danh là người chưa bao giờ thất bại trong các nhiệm vụ bất chấp có những thứ vô cùng kỳ quặc. Anh đã nhận nhiệm vụ bất khả thi với việc phải xây dựng một đội quân thiện chiến nhất, tài giỏi nhất. Thế nhưng trái ngược với những gì số đông nghĩ, Klaus lựa chọn những người hoàn toàn không có kinh nghiệm, họ phải ứng dụng kiến thức học được trong sách để hoàn thành nhiệm vụ được giao!