Kẻ Xâm Nhập - Intruder xoay quanh câu chuyện về người đàn ông Seo Jin đã từng có một gia đình rất hạnh phúc thế nhưng, biến cố đã xảy ra khi người em gái Yoo Jin mất tích một cách bí ẩn. Vào 25 năm sau người em gái Yoo Jin bỗng bất ngờ quay trở về. Nhưng Seo Jin lại cảm thấy có điều gì đó vô cùng bí ẩn của người phụ nữ này, anh nghi ngờ cô đã mạo danh người em gái mình để làm điều gì đó mờ ám. Vì vậy anh bắt đầu thực hiện một kế hoạch để vạch trần bộ mặt thật sự của cô gái ấy.